El primer jueves de cada mes, de enero a octubre, se lleva a cabo una Sesión Académica con la participación de reconocidos Endoscopistas de instituciones como Hospital General de México, Centro Médico Nacional Siglo XXI, Hospital Ángeles del Pedregal, Instituto Nacional de la Nutrición, Hospital General Manuel Gea González, Instituto Nacional de Cancerología, entre otros, así como profesores internacionales; en donde se presentan temas de actualidad y gran interés relacionados con la endoscopia.

Anualmente, en coordinación con Instituciones de Salud así como con las Universidades Estatales, se organizan Reuniones Regionales, las cuales se programan en diferentes estados de la República Mexicana. El objetivo fundamental de las Reuniones Regionales es hacer partícipes en la localidad y ciudades circunvecinas a los Médicos Endoscopistas de la zona y compartir los conocimientos con Médicos Especialistas y Médicos Generales. Apartir del 2005 se implemento un evento donde se revisa los más novedoso presentado en la DDW. Así se difunde la enseñanza básica de la materia como también los avances más recientes en la misma cumpliendo con las metas y estatutos de la Asociación.

La Asociación brinda el aval a cursos hospitalarios de alto nivel académico referentes a la especialidad, colabora con otras Asociaciones Médicas y está reconocida por el Consejo Mexicano de Gastroenterología, la Academia Mexicana de Medicina, la Academia Mexicana de Cirugía, la Organización Panamericana de Endoscopia Gastrointestinal y la Organización Mundial de Endoscopia Digestiva.